22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12189 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12189  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.25676e-41  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1760  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.72 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0293  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.58 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6991  hypothetical protein  37.94 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220253  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0845  alkylhydroperoxidase  33.93 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0545  alkylhydroperoxidase  37.58 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.87 
 
 		 388 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2703  alkylhydroperoxidase  38.79 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582162  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4103  hypothetical protein  39.22 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0548  carboxymuconolactone decarboxylase  33.43 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5896  hypothetical protein  30.3 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  32.58 
 
 		 192 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  33.71 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  30.93 
 
 		 204 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  34.38 
 
 		 192 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  34.38 
 
 		 192 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.09 
 
 		 176 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.91 
 
 		 176 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0617  hypothetical protein  25.69 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  34.38 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.65 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  36.92 
 
 		 172 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>