154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4851 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  83.42 
 
 
204 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  72.11 
 
 
509 aa  305  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  75.79 
 
 
207 aa  304  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  73.96 
 
 
192 aa  303  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  73.96 
 
 
192 aa  303  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.28 
 
 
189 aa  158  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.76 
 
 
203 aa  121  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.79 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.16 
 
 
184 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 
201 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0284  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.76 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  31.85 
 
 
185 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  31.85 
 
 
185 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.13 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.13 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.13 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  33.13 
 
 
182 aa  92  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.13 
 
 
182 aa  92  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  33.13 
 
 
182 aa  92  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.13 
 
 
182 aa  92  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  33.13 
 
 
182 aa  92  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.13 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  31.11 
 
 
189 aa  87.8  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  28.85 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  36.27 
 
 
113 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 
159 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.42 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 
159 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1217  hypothetical protein  18.99 
 
 
207 aa  61.6  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  32 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  32 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  31.2 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 
159 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  28.93 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.84 
 
 
159 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  26 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.69 
 
 
159 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.14 
 
 
156 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.85 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  25.86 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  27.2 
 
 
151 aa  51.6  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.54 
 
 
159 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.2 
 
 
159 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 
143 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.86 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  28.49 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  32.8 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.05 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  27.64 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  27.64 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.66 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.93 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1938  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0420591  normal  0.0162629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  29.11 
 
 
177 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  27.34 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.13 
 
 
155 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  33.68 
 
 
154 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  27.27 
 
 
170 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  23.58 
 
 
196 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  31.46 
 
 
150 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.67 
 
 
149 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.51 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.4 
 
 
143 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.86 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12189  hypothetical protein  32.58 
 
 
344 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.25676e-41  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.12 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.8 
 
 
157 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  25.66 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1838  hypothetical protein  31.65 
 
 
88 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866107  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  27.19 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.76 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.86 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  22.86 
 
 
283 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.68 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.3 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  25 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.73 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3899  hypothetical protein  37.88 
 
 
96 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00567154  normal  0.0318499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  25 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  25 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  25 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.14 
 
 
159 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  28.16 
 
 
179 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  25 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.41 
 
 
145 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  27.43 
 
 
158 aa  45.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>