17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4103 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4103  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6991  hypothetical protein  51.93 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220253  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.14 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0545  alkylhydroperoxidase  45.97 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2703  alkylhydroperoxidase  47.77 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582162  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1760  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.81 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0293  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.44 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0845  alkylhydroperoxidase  35.09 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0548  carboxymuconolactone decarboxylase  40.54 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12189  hypothetical protein  39.71 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.25676e-41  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5896  hypothetical protein  30.63 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.63 
 
 		 211 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  25 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1701  hypothetical protein  29.11 
 
 		 177 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0984593  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  26.8 
 
 		 144 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.17 
 
 		 201 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.66 
 
 		 176 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>