18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2703 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2703  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 360 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582162  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6991  hypothetical protein  54.55 
 
 		 374 aa  319  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220253  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0545  alkylhydroperoxidase  50.14 
 
 		 369 aa  291  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.56 
 
 		 388 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4103  hypothetical protein  47.59 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1760  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.01 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0293  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.8 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0845  alkylhydroperoxidase  37.82 
 
 		 336 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0548  carboxymuconolactone decarboxylase  39.4 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12189  hypothetical protein  38.93 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.25676e-41  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.72 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5896  hypothetical protein  32.16 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.22 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.74 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.93 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.93 
 
 		 135 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.71 
 
 		 178 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 134 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>