154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5750 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
135 aa  279  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  69.17 
 
 
134 aa  203  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  70.9 
 
 
137 aa  201  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  64.44 
 
 
135 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  62.69 
 
 
137 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  61.19 
 
 
135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  60.15 
 
 
132 aa  168  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.81 
 
 
130 aa  156  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2036  alkylhydroperoxidase  60.34 
 
 
143 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466607  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  60.87 
 
 
118 aa  151  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.26 
 
 
130 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.49 
 
 
130 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  56.1 
 
 
130 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0188  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.31 
 
 
233 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  37.08 
 
 
194 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.2 
 
 
192 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  36.36 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.7 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
201 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.2 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  38.2 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.2 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 
192 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.89 
 
 
216 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.09 
 
 
189 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 
192 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  36.71 
 
 
181 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  34.83 
 
 
192 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  35.56 
 
 
201 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.23 
 
 
181 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.39 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.83 
 
 
192 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.95 
 
 
200 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.96 
 
 
192 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.96 
 
 
192 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.45 
 
 
217 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.58 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.96 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.88 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.05 
 
 
201 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  37.18 
 
 
202 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  35.63 
 
 
194 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.98 
 
 
178 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.29 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.5 
 
 
212 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.09 
 
 
192 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  34.88 
 
 
201 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.5 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.48 
 
 
199 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  35.63 
 
 
201 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  29.7 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.68 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.72 
 
 
196 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.48 
 
 
198 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.21 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.33 
 
 
225 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  32 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.76 
 
 
192 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.68 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  35.23 
 
 
214 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.62 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  32.86 
 
 
192 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  28.92 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.21 
 
 
179 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  45.24 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.41 
 
 
178 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.16 
 
 
193 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.16 
 
 
193 aa  47.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.11 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  32.56 
 
 
191 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  23.42 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  34.57 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 
186 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 
186 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.46 
 
 
214 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.07 
 
 
202 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.42 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.5 
 
 
194 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.63 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  38.75 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.25 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  31.31 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  34.67 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.88 
 
 
207 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  30.38 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  25.84 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.08 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  39.34 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
235 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  32.97 
 
 
209 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.43 
 
 
191 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.67 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.41 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  37.66 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 
191 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
196 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>