162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5015 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
130 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  96.92 
 
 
130 aa  267  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.99 
 
 
130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  64.8 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  59.32 
 
 
132 aa  154  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  55.28 
 
 
135 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  52.34 
 
 
135 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.49 
 
 
135 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  56.56 
 
 
134 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  57.02 
 
 
137 aa  146  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  54.87 
 
 
118 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2036  alkylhydroperoxidase  50.38 
 
 
143 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466607  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.14 
 
 
137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0188  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.91 
 
 
233 aa  124  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.61 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.71 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.18 
 
 
181 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.92 
 
 
178 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  34.65 
 
 
181 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  38.81 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  38.81 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  34.18 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 
177 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  32.88 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.28 
 
 
180 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 
197 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.3 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 
177 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  28.28 
 
 
178 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.39 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.55 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  29.81 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  27.55 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  26.17 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  35.29 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  45 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  42.59 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.84 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  39.71 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.88 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.84 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 
192 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.06 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.85 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.27 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  31.82 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.14 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  25.42 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  42.31 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.94 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.36 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  30.56 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  37.78 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  37.78 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  42.42 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.42 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.57 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  30.38 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.94 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.96 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.96 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.86 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.94 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  33.8 
 
 
115 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  36.78 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  25.42 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  38.36 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.26 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  27.2 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  34.21 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  27.69 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  27.37 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  30.59 
 
 
199 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.24 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.25 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.67 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  34.92 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  31.82 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.62 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  35.59 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  31.15 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  27.78 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>