67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2298 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  345  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  98.25 
 
 		 171 aa  341  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  46.67 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  46.11 
 
 		 205 aa  141  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  38.55 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  34.91 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  34.91 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  39.02 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  39.39 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  39.64 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  38.46 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  42.28 
 
 		 181 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  35.5 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  38 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  35.12 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  39.26 
 
 		 198 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  33.73 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  40.79 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  33.73 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  37.8 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.53 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.64 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  37.87 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.05 
 
 		 186 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.35 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.48 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.34 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  33.96 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.25 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  31.21 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  31.93 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  36.14 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  36.14 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  36.14 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  36.14 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  36.14 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.39 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  35.54 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  36.55 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  49.06 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.78 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.84 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.19 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.85 
 
 		 130 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  43.4 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  40.32 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  32.43 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.37 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.37 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.37 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  41.3 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2036  alkylhydroperoxidase  32.84 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 		 118 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.64 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>