40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0807 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
212 aa  443  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  23.78 
 
 
171 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  29.75 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  23.78 
 
 
171 aa  62  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  29.01 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  34.12 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  33.72 
 
 
178 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  25.61 
 
 
180 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  25.48 
 
 
169 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.84 
 
 
195 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  23.08 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  23.08 
 
 
177 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  23.75 
 
 
175 aa  54.7  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.63 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  26.35 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  24.54 
 
 
176 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.07 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  28.92 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  21.66 
 
 
195 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.9 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  22.5 
 
 
175 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  25.16 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  31.33 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  41.54 
 
 
112 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  34.83 
 
 
177 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  28 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  29.63 
 
 
181 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.86 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  26.25 
 
 
198 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  27.38 
 
 
180 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  25.17 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.73 
 
 
186 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  36.07 
 
 
114 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  24.79 
 
 
128 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
150 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0858  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 
88 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0911009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45 
 
 
152 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.87 
 
 
111 aa  41.6  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  42.22 
 
 
144 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>