60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4244 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  77.22 
 
 
178 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  80.25 
 
 
178 aa  271  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  62.5 
 
 
176 aa  222  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  54.39 
 
 
178 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  52.05 
 
 
175 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  55.68 
 
 
177 aa  191  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  51.46 
 
 
175 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  53.8 
 
 
180 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  55.49 
 
 
173 aa  184  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  56.73 
 
 
179 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  53.37 
 
 
177 aa  174  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  54.8 
 
 
181 aa  170  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  52.35 
 
 
181 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  50.31 
 
 
177 aa  165  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  50.31 
 
 
205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  47.4 
 
 
194 aa  160  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  54.67 
 
 
176 aa  157  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  53.05 
 
 
181 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  52.76 
 
 
198 aa  154  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.15 
 
 
186 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.15 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  38.46 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  39.16 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.48 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.83 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.83 
 
 
173 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  43.79 
 
 
185 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  41.28 
 
 
175 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  36.42 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.59 
 
 
195 aa  98.6  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  39.88 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.59 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.18 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.59 
 
 
196 aa  91.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  62.03 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.28 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  38.15 
 
 
175 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  38.15 
 
 
175 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 
175 aa  87.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  38.15 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  38.73 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  38.73 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  38.73 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  38.73 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.73 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.73 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  38.73 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  35.06 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.9 
 
 
212 aa  58.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2166  hypothetical protein  25.43 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.26 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.26 
 
 
143 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  47.37 
 
 
143 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.1 
 
 
143 aa  40.8  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>