47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3086 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  63.73 
 
 		 196 aa  244  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.48 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  51.22 
 
 		 169 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  39.24 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  33.33 
 
 		 175 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  37.82 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  32.91 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  36.26 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  36.26 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  36.26 
 
 		 173 aa  98.6  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  32.91 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  34.1 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  33.33 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  35.03 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  34.97 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.22 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  36.71 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.84 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  31.61 
 
 		 177 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  45.24 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  34.57 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  32.89 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  29.8 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.43 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  44 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  42.39 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  42.39 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  29.89 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.29 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  49.02 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.83 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.32 
 
 		 174 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  21.66 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  23.75 
 
 		 175 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  28.76 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.55 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  41.94 
 
 		 167 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.5 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 		 113 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.22 
 
 		 153 aa  41.2  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.31 
 
 		 146 aa  41.2  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  34.92 
 
 		 145 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>