48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4528 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  63.73 
 
 		 195 aa  244  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.08 
 
 		 195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  54.78 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  37.18 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  37.34 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  32.91 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  35.26 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 173 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  34.18 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  34.18 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  33.97 
 
 		 175 aa  94.4  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  36.99 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  35.53 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  31.06 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  32.12 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.71 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  35.12 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  33.12 
 
 		 171 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  35.26 
 
 		 179 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  32.48 
 
 		 171 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  32.26 
 
 		 177 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.31 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.03 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  44.05 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  34.72 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  27.85 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  33.57 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  34.06 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  25.16 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.71 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.9 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  27.81 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  25 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  23.12 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  45.1 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  24.56 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  24.56 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  24.56 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  23.98 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  23.98 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  23.98 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.43 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.94 
 
 		 145 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  24.86 
 
 		 175 aa  41.2  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>