70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2888 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
173 aa  351  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  54.97 
 
 
175 aa  205  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  55.56 
 
 
175 aa  203  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  59.87 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  59.04 
 
 
181 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  57.8 
 
 
178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  56.07 
 
 
180 aa  187  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  55.21 
 
 
180 aa  187  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  54.97 
 
 
178 aa  184  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  59.76 
 
 
181 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  53.33 
 
 
177 aa  177  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  51.15 
 
 
205 aa  176  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  60.78 
 
 
181 aa  174  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  53.76 
 
 
176 aa  174  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  54.32 
 
 
198 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  53.5 
 
 
179 aa  164  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  50.29 
 
 
194 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  59.86 
 
 
176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  53.53 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  50.89 
 
 
177 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  39.76 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  38.55 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.24 
 
 
186 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.12 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  42.69 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  41.62 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.12 
 
 
173 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  44.52 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.24 
 
 
186 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.42 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  40.12 
 
 
175 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  40.12 
 
 
175 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.88 
 
 
196 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  39.53 
 
 
175 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.95 
 
 
173 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.01 
 
 
174 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  39.53 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  39.53 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  39.53 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.26 
 
 
195 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  40.46 
 
 
175 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  40.46 
 
 
175 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  40.46 
 
 
175 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  40.46 
 
 
175 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  40.46 
 
 
175 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.46 
 
 
175 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.46 
 
 
175 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  40.46 
 
 
175 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  34.16 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  40.12 
 
 
175 aa  97.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  64 
 
 
83 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  35.67 
 
 
173 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.88 
 
 
212 aa  62.4  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.84 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.56 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.78 
 
 
145 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  38.78 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.78 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
143 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.72 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.78 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 
155 aa  41.2  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
151 aa  41.2  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.57 
 
 
152 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2166  hypothetical protein  23.84 
 
 
175 aa  40.8  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.55 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.92 
 
 
149 aa  40.8  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.86 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.66 
 
 
130 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>