45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4003 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 83 aa  168  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  86.3 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  62.03 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  57.5 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  66.25 
 
 		 180 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  56.25 
 
 		 175 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  60.98 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  57.65 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  64 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  48.78 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  48.78 
 
 		 205 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  61.33 
 
 		 178 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  69.81 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  71.15 
 
 		 181 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  55 
 
 		 176 aa  84  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  65.33 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  51.22 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  56.41 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  52.38 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  49.35 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  50.59 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  50.79 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  53.06 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  51.35 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.72 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.19 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.72 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.65 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.18 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  40.68 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.26 
 
 		 196 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.14 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  37.14 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  34.29 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.29 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 		 175 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 		 175 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.67 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>