55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2289 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  57.06 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  53.98 
 
 
178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  56.4 
 
 
176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  58.6 
 
 
178 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  50.29 
 
 
175 aa  187  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  50.29 
 
 
175 aa  184  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  50.84 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  52.07 
 
 
173 aa  177  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  52.87 
 
 
177 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  51.18 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  50.29 
 
 
177 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  47.37 
 
 
180 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  48.47 
 
 
177 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  56.71 
 
 
181 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  48.47 
 
 
205 aa  158  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  49.43 
 
 
194 aa  157  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  53.59 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  52.47 
 
 
198 aa  143  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  50.67 
 
 
176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  40.36 
 
 
171 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  40.36 
 
 
171 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.16 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.42 
 
 
186 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.42 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  37.57 
 
 
174 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  38.55 
 
 
175 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.95 
 
 
173 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.44 
 
 
196 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  46.2 
 
 
185 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.1 
 
 
174 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.95 
 
 
186 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
175 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  37.87 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  41.57 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  41.57 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  37.87 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.9 
 
 
195 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.74 
 
 
195 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  38.46 
 
 
175 aa  91.3  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  40.83 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  37.87 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  37.87 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  37.87 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  37.87 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.87 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.87 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  37.87 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  56.41 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.71 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.22 
 
 
150 aa  44.7  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>