74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3759 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 169 aa  347  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.17 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.78 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.22 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  36.42 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  36.59 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  33.93 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  37.04 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  33.99 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  33.99 
 
 		 180 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  37.04 
 
 		 205 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  45.74 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  34.16 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  33.55 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  33.12 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  46.43 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.07 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  35.26 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.63 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  30.12 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  34.36 
 
 		 198 aa  84.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  49.35 
 
 		 179 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.46 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  46.67 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  31.21 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  34.97 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  31.21 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  46.67 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.6 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.84 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.6 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.48 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  25.14 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  25.14 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.03 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  25.14 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  25.14 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  25.14 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  25.49 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  43.14 
 
 		 83 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  26.54 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  26.54 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  26.54 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.54 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.54 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  26.54 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  26.54 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  24.14 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  34.15 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  45.24 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  37.25 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  37.25 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  35.48 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  43.9 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  24.69 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 		 158 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0404  alkylhydroperoxidase-like protein  33.33 
 
 		 200 aa  42  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00830892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.2 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.14 
 
 		 119 aa  41.2  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  36 
 
 		 113 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.96 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>