54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1000 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 174 aa  357  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  86.78 
 
 		 174 aa  290  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  81.5 
 
 		 173 aa  287  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  80.92 
 
 		 173 aa  285  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  79.77 
 
 		 173 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  79.19 
 
 		 175 aa  261  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  79.19 
 
 		 175 aa  261  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  79.19 
 
 		 175 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  78.61 
 
 		 175 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  78.03 
 
 		 175 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  78.03 
 
 		 175 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  75.14 
 
 		 175 aa  253  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  79.43 
 
 		 175 aa  248  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  80 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  80 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  80 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  79.43 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  80 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  80 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  80 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  81.65 
 
 		 173 aa  247  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  78.03 
 
 		 175 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  37.29 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  36.87 
 
 		 205 aa  121  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  42.69 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  38.18 
 
 		 171 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  37.58 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  39.18 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  33.72 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  40.52 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  33.14 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  40.25 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  38.65 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  37.8 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  38.82 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  36.26 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  34.36 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  36.09 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  33.13 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  36.94 
 
 		 198 aa  84.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  35.71 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.92 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  30.95 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.32 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  31.21 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.27 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.82 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.16 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  36.02 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.68 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  33.78 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  22.89 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>