59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3530 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 176 aa  348  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  62.94 
 
 		 175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  63.74 
 
 		 175 aa  230  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  61.85 
 
 		 178 aa  214  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  60.59 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  61.76 
 
 		 181 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  54.94 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  57.99 
 
 		 173 aa  187  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  63.41 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  55.41 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  53.53 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  58.64 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  52.33 
 
 		 194 aa  167  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  55.56 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  51.76 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  47.83 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  47.83 
 
 		 205 aa  154  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  48.86 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  47.13 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  52.41 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.34 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.02 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  83.13 
 
 		 83 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  49.11 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.7 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  36.69 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  36.69 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.09 
 
 		 195 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.25 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.18 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  33.94 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  34.68 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.55 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.73 
 
 		 173 aa  84.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  31.65 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  32.72 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  31.48 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  32.67 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  31.48 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  31.48 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  31.48 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  31.48 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.01 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  30.25 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.88 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  38.67 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  31.63 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 		 144 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 143 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>