59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4444 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  75.44 
 
 		 175 aa  266  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  74.85 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  77.9 
 
 		 181 aa  245  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  69.94 
 
 		 180 aa  241  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  66.08 
 
 		 178 aa  228  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  59.04 
 
 		 173 aa  207  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  62.34 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  52.6 
 
 		 178 aa  187  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  53.7 
 
 		 180 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  50.57 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  54.78 
 
 		 178 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  62.84 
 
 		 176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  55.83 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  48.54 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  48.54 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  50.88 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  47.09 
 
 		 194 aa  150  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  48.8 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.11 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  46.75 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.7 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  39.05 
 
 		 171 aa  130  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.37 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  45.88 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.82 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.77 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.34 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.18 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  38.65 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  39.77 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.88 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.52 
 
 		 195 aa  98.2  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  33.12 
 
 		 169 aa  97.8  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.26 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  36.26 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  35.67 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  35.67 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  35.67 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  37.43 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  67.14 
 
 		 83 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  36.84 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  36.84 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  36.84 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  36.84 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  36.84 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  34.67 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.75 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  44.64 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  47.5 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  32.89 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  45.95 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>