56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12457 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  100 
 
 		 177 aa  360  8e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  74.29 
 
 		 177 aa  259  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  55.21 
 
 		 180 aa  180  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  53.25 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  53.5 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  54.14 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  53.53 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  49.7 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  46.15 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  49.7 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  49.11 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  51.66 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  47.93 
 
 		 181 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  44.91 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  43.45 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  43.45 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  50.61 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  48 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  41.36 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  30.12 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.76 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  33.13 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  39.35 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.52 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  32.53 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.46 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.42 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.88 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  39.31 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.48 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  37.41 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  34.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  34.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  34.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  34.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  34.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  35.06 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  34.1 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4003  alkylhydroperoxidase  49.35 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.32 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2166  hypothetical protein  24.72 
 
 		 175 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.89 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>