52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1983 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2398  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1488  alkyl hydroperoxide reductase D  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0368228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2510  alkyl hydroperoxide reductase D  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3322  alkyl hydroperoxide reductase D  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000115854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1983  alkyl hydroperoxide reductase D  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0162336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1256  alkyl hydroperoxide reductase D  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2355  4-carboxymuconolactone decarboxylase  99.43 
 
 
175 aa  357  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0231996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1965  carboxymuconolactone decarboxylase  93.14 
 
 
175 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464314  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5252  carboxymuconolactone decarboxylase  92.57 
 
 
175 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000857718  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1941  carboxymuconolactone decarboxylase  92.57 
 
 
175 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0223719  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6138  carboxymuconolactone decarboxylase  92.57 
 
 
175 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  90.86 
 
 
175 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000315441  decreased coverage  0.000000495243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1929  carboxymuconolactone decarboxylase  90.86 
 
 
175 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0154666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2091  alkyl hydroperoxide reductase D  94.86 
 
 
175 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1330  carboxymuconolactone decarboxylase  92 
 
 
175 aa  296  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388186  decreased coverage  0.0000767761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1901  Carboxymuconolactone decarboxylase  80.92 
 
 
173 aa  296  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.211902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1572  Carboxymuconolactone decarboxylase  80.35 
 
 
173 aa  295  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0550639  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1951  alkylhydroperoxidase AhpD core  79.77 
 
 
173 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.907932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1000  alkylhydroperoxidase  80 
 
 
174 aa  264  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1645  putative antioxidant protein  76.88 
 
 
175 aa  263  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2310  alkylhydroperoxidase AhpD core  78.29 
 
 
174 aa  261  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564994  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1364  carboxymuconolactone decarboxylase  81.01 
 
 
173 aa  246  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2888  alkylhydroperoxidase  40.7 
 
 
173 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0707  alkyl hydroperoxide reductase D  35.09 
 
 
175 aa  104  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0970  alkylhydroperoxidase, AhpD family  38.6 
 
 
178 aa  103  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192344 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2271  hypothetical protein  38.55 
 
 
171 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0522  peroxiredoxin reductase (NAD(P)H)  35.56 
 
 
205 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1656  alkyl hydroperoxide reductase D protein AhpD  35.96 
 
 
177 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0383236  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3831  alkylhydroperoxidase  33.92 
 
 
175 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2298  hypothetical protein  37.35 
 
 
171 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6565  Peroxiredoxin  38.85 
 
 
178 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2215  alkylhydroperoxidase-like protein  37.21 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.512399  normal  0.718075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4244  alkylhydroperoxidase, AhpD family  38.65 
 
 
180 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4444  alkylhydroperoxidase  36.69 
 
 
181 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5864  alkylhydroperoxidase, AhpD protein  40.24 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1424  alkylhydroperoxidase, AhpD family  36.6 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1957  alkylhydroperoxidase AhpD family  35.47 
 
 
176 aa  87.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.217554  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2289  alkylhydroperoxidase  40.29 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0232059  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2431  alkylhydroperoxidase  35.09 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4101  alkylhydroperoxidase  32.95 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3586  alkylhydroperoxidase  35.9 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35684  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2228  alkylhydroperoxidase, AhpD family  32.35 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12457  alkyl hydroperoxide reductase D protein ahpD  34.68 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3530  alkylhydroperoxidase  30.28 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  normal  0.0421612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0325  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.32 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3759  alkylhydroperoxidase  26.54 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.197392  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0336  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.32 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4528  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.25 
 
 
196 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00331574  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0314  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.29 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2147  alkylhydroperoxidase  33.8 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0456192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.28 
 
 
195 aa  48.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3086  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.64 
 
 
195 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  0.0335839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>