120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1046 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  93.06 
 
 		 144 aa  273  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  89.58 
 
 		 144 aa  263  7e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  47.73 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  43.41 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  38.97 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.92 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  46.46 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  34.13 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.83 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1559  alkylhydroperoxidase  33.03 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  34.26 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  42.19 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.57 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  42.19 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  42.19 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.28 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  41.18 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  43.75 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.98 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.23 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  36.23 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  36.23 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  33.71 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  29.76 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  29.29 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  31.63 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  31.52 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  32.84 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  32.11 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  34.38 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.66 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.78 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.58 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  30.39 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  33.8 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.29 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.09 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  29.27 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.71 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.43 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.76 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  30.88 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  41.27 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.81 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.81 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  27.18 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.78 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  31.34 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  29 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  29.76 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  41.27 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.8 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  46.34 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  31.33 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  35.82 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.85 
 
 		 176 aa  42.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.95 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.35 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.4 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.34 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  37.5 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  32.84 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  32.43 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  22.34 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6128  carboxymuconolactone decarboxylase  40.3 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 		 116 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 		 114 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  32.89 
 
 		 121 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  25 
 
 		 196 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  27.55 
 
 		 183 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  32.89 
 
 		 121 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.03 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.09 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>