193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3027 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 112 aa  223  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  62.73 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.88 
 
 		 111 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  63.16 
 
 		 111 aa  130  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  67.78 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  65.66 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  61.76 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.57 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.77 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1090  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.51 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.64 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  38.2 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.65 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  50.72 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  41.03 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  48.68 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  41.11 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  42.68 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1150  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.02 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  40.66 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  37.08 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.84 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  38.64 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.84 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  37.89 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.38 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.78 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  36.78 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.96 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.23 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2858  carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.08 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  37.36 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2638  carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2554  carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2829  carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.571755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2589  carboxymuconolactone decarboxylase  37.84 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  36.9 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  36.9 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2835  carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  40.23 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  37.18 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.83 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.33 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.67 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  39.29 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  36.73 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.96 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1814  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  42.86 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.23 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1491  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  38.2 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.2 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  38.2 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  38.2 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  38.2 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.71 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.12 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  35.19 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.83 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.16 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  39.44 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  42.03 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  42.03 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  37.21 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  35.96 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.08 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  36.67 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.03 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  42.03 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  42.03 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.08 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  44.44 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  34.83 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>