142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3075 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 121 aa  247  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2638  carboxymuconolactone decarboxylase  70.34 
 
 		 146 aa  182  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2829  carboxymuconolactone decarboxylase  70.34 
 
 		 146 aa  182  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.571755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2554  carboxymuconolactone decarboxylase  70.34 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2835  carboxymuconolactone decarboxylase  70.34 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2858  carboxymuconolactone decarboxylase  69.23 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  69.49 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  70.09 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  70.09 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2589  carboxymuconolactone decarboxylase  68.91 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  69.23 
 
 		 121 aa  178  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.25 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  43.42 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  37.17 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  39.53 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  35.58 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.53 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  40.48 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  42.5 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.51 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.29 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.04 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  37.21 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  36.54 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  36.46 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.79 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.26 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  40.23 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  33.98 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.8 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.63 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1090  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.27 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.65 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  36.71 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  36.17 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  37.97 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.653003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  35.56 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  32.53 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  32.53 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  32.35 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.5 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.94 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  39.19 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  31.18 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.32 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  35 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  35.23 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.61 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  38.89 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  29.46 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1491  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.23 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1814  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  35.23 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  33.72 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  34.83 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  36 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5610  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.070686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  34.83 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  38.36 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  32.89 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  30.11 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  30.11 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  34.12 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  35.8 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  34.12 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  32.18 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.98 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  35.37 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  26.74 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  29.79 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.71 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.71 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.71 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  25.38 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.71 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.71 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.71 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.51 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.71 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  31.18 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08920  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.35 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  29.35 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1150  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.28 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.92 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  29.76 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.89 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.73 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>