145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0361 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 127 aa  262  8.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  77.12 
 
 		 121 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  66.67 
 
 		 121 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  65.83 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08920  Carboxymuconolactone decarboxylase  65.38 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  61.32 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.52 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.38 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1032  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.47 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  53 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  48.54 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0411  alkylhydroperoxidase AhpD  49.06 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331538  normal  0.0612182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  37.89 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  31.13 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.74 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  40.74 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  41.25 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.48 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.36 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  27.18 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.43 
 
 		 211 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  32.69 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.43 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.85 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.97 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  27.12 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.86 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.68 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.83 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.86 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.86 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.86 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  34.57 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  24.55 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.41 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  24.55 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.57 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  34.62 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  38.03 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.34 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.62 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.62 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  34.09 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  34.09 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  32.94 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.68 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  32 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  27.62 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  30.53 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  30.53 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.11 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.04 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.86 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.17 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.18 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.18 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  34.48 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  27.88 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  30.11 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.18 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  31.33 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  25.93 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  33.82 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.84 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  32.47 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  25.93 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  29.63 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.35 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.59 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.653003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.23 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.67 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.43 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.85 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.23 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.41 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.41 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  30.26 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  30.12 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  30.49 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>