156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2644 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1150  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.2 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  48.78 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  51.19 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  46.91 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  44.12 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.59 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  44.71 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  38.1 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.09 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  38.82 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  50.72 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  50.72 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  37.37 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  39.81 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.51 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.38 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  39.51 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  43.21 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.92 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.26 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  38.82 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.82 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  42.17 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.25 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  36.54 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  33.64 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  39.02 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  35.05 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  37.5 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  35.83 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.58 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.21 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.8 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  33.06 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.44 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  36.63 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.8 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  36.26 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  40.74 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  42.68 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.12 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  35.71 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  38.37 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  31.13 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  37.8 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.13 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.13 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.13 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.13 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  31 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  31 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  33.64 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  33.64 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.95 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  36.59 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  32.65 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  33.64 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1814  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  35.09 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.93 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1491  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.09 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5610  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.24 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.070686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  42.42 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  35.16 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.69 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0615  alkylhydroperoxidase  37.33 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  30.69 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  30.69 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  30.69 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  30.69 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  33.73 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.76 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.34 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.34 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.34 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.34 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  40.62 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.31 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  28.97 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>