168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0518 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  191  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  38.2 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  42.5 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  45.57 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  42.17 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  42.35 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.78 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.9 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.35 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  43.04 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  43.04 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.67 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.58 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.89 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  45.57 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.46 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  47.44 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.1 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  39.76 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.04 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  40.23 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  36.26 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  37.21 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.2 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.7 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  38.2 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  41.11 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  51.67 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.56 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  40 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  35.63 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.56 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.56 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.56 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.71 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  38.37 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1814  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  40.51 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1491  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.51 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  37.08 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.56 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.56 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  51.67 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  49.33 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.96 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  41.98 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.56 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  37.08 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.71 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.36 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  39.36 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  39.36 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  40.54 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.26 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.39 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  36.78 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.78 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  36.78 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  36.78 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  36.78 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  35.63 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.8 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.26 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.67 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.62 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.62 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  45.31 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  45.16 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  45.16 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  39.24 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  35.44 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  45.16 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.88 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  37.04 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.93 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  38.75 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  35.11 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.18 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  35.56 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0068  DNA-binding response regulator  33.72 
 
 		 424 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  38.55 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>