143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1814 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1491  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 116 aa  239  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1814  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  100 
 
 		 116 aa  239  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.71 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.25 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  42.59 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  39.09 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  39.09 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  40.2 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  34.55 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.58 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.57 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  35.4 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  40.2 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  34.02 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  30.36 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  35.16 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.29 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  40.51 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.31 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  33.02 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  35.87 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  35.87 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  35.05 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  37.78 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.63 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  37.78 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  31.25 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.65 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.26 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.34 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.69 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  34.34 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.26 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.26 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  28.71 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.69 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  35.09 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.9 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.38 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  45.71 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  30.61 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  30.61 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.35 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.42 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.96 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.36 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  31.07 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.42 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.42 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.42 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.68 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  35.63 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.85 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  35.45 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  31.07 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.48 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.01 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.1 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  32.95 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  31.18 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  31.18 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  32.08 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  29.7 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.23 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.18 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.7 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  29.7 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  29.7 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  29.7 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  33.65 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  30.56 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  41.51 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  36.14 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  43.1 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  43.1 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  34.02 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  41.51 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.63 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.19 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0068  DNA-binding response regulator  31.96 
 
 		 424 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  25.44 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  35.37 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  37.31 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.1 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>