201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4301 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  69.61 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  63.89 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  65.09 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  62.26 
 
 		 111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  58.88 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  63.54 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  56.96 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1090  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.62 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.62 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  43.21 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  38.18 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.37 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.91 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  45.57 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.23 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  39.18 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  43.53 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  44.71 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  40.23 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  40.48 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  40.48 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  43.9 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.27 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  36.27 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  45.57 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  40.45 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.63 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.04 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2554  carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.78 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2589  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  39.08 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.8 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  34.15 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2858  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2638  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.28 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.96 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.63 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2829  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.571755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.96 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  33.65 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  40.23 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.7 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2835  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  39.02 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.67 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  36.67 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  37.93 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  38.27 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  32.38 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  38.37 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  37.5 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  38.37 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  39.02 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  40.51 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  38.82 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  41.67 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.24 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  40.51 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  42.11 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.08 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  31.87 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.25 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  34.95 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.37 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  34.95 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.08 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.79 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.95 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  34.95 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  34.95 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  34.95 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.56 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  37.8 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  37.8 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.79 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  36.59 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.38 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  33.72 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.38 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  29.82 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.63 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  36.71 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>