97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3172 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1090  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  97.27 
 
 		 110 aa  219  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  82.73 
 
 		 110 aa  190  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  62.73 
 
 		 110 aa  147  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  65.45 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  58.33 
 
 		 111 aa  129  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  48.1 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.62 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  46.67 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  44.3 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  38.14 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  41.77 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  38.75 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2858  carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2554  carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2829  carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.571755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2835  carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2638  carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52425  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.01 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2589  carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.04 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.11 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.07 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  32.95 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.38 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  30.39 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.96 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.96 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  29.09 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  30.61 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  31.96 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  30.61 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.95 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.44 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.06 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.15 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  34 
 
 		 268 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.61 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.1 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  31.91 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.21 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  30.23 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  31.87 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  31.91 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  30.23 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  39.73 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  30.21 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  27.84 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0615  alkylhydroperoxidase  30 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  31.03 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  29.52 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  32.05 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.18 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.33 
 
 		 119 aa  43.9  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  32.61 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  27.5 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  31.18 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.34 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2010  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.33 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  36.07 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  32.61 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.89 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  32.18 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.62 
 
 		 123 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  27.62 
 
 		 123 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.21 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  29.29 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  35.21 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0121  hypothetical protein  28.24 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  27.84 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2663  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.05 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  26.37 
 
 		 96 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  27.91 
 
 		 126 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>