51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2010 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2010  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2663  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.7 
 
 
134 aa  174  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  36.89 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  38.05 
 
 
183 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  39.82 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.68 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.68 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  28.72 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4347  alkylhydroperoxidase AhpD  37.78 
 
 
169 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  30.95 
 
 
101 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  39.71 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  32.47 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.11 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  33.78 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1090  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.24 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.24 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  40.3 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  35.38 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  28.43 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  25.26 
 
 
115 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2835  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
122 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2858  carboxymuconolactone decarboxylase  29.07 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.26 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2638  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.73 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2589  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2554  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2829  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.571755  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  38.33 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  37.7 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1378  alkylhydroperoxidase  30.23 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  25.64 
 
 
115 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 
114 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.26 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  31.76 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  40.43 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  40.43 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  31.82 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  29.49 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  26.32 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 
115 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>