129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4347 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4347  alkylhydroperoxidase AhpD  100 
 
 		 169 aa  344  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  46.23 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  42.35 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2010  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.23 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  40.51 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.94 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.66 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.42 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  56.6 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2663  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.61 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  50.82 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.42 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.11 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.21 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.94 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  35.53 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 115 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.37 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  36.36 
 
 		 98 aa  52.4  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  52.83 
 
 		 114 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.94 
 
 		 130 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 		 115 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  49.18 
 
 		 111 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  51.02 
 
 		 112 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  51.02 
 
 		 112 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.34 
 
 		 110 aa  50.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  36 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  42.19 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.7 
 
 		 110 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  41.54 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  37.88 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  41.27 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.89 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  52.27 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 115 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  33.67 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  46.94 
 
 		 123 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  40.62 
 
 		 111 aa  48.5  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  36.07 
 
 		 111 aa  48.5  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.94 
 
 		 123 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.06 
 
 		 111 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.06 
 
 		 111 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.06 
 
 		 109 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 108 aa  47.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  38.71 
 
 		 101 aa  47.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.25 
 
 		 114 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.06 
 
 		 109 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 109 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 109 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  45 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  37.7 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 109 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 109 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.02 
 
 		 125 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  47.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  44.64 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  46.81 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  42.19 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  28 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 		 117 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  37.66 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  34.92 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2036  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  34.92 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.31 
 
 		 119 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 110 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.03 
 
 		 114 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0188  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.63 
 
 		 233 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 		 115 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  40.98 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 		 117 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 		 116 aa  45.1  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  41.54 
 
 		 119 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  44.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.23 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  45.61 
 
 		 114 aa  44.3  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.7 
 
 		 150 aa  44.3  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  43.14 
 
 		 117 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.18 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.6 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  43.14 
 
 		 114 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  35.62 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>