150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12358 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 116 aa  240  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  71.93 
 
 		 116 aa  184  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1032  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.26 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.39 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  55.14 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08920  Carboxymuconolactone decarboxylase  56 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  56.12 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  50.46 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  49.54 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  48.54 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0411  alkylhydroperoxidase AhpD  44.12 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331538  normal  0.0612182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  32.74 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.11 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  34.52 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.14 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.61 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  28.18 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  32.04 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  32.04 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.82 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  34.09 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  36.49 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  30.95 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.49 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  36.23 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.35 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  32.98 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  23.42 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  23.42 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  28.38 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  28.05 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.85 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.89 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  30.21 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  29.03 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.84 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.07 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  33.85 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.84 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  33.85 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.59 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  24.77 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  27.37 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1150  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.47 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675038 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  28 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.09 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.29 
 
 		 203 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  30.49 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.82 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.36 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.85 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.1 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.653003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.07 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  31.88 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  32.84 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  25.23 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  27.47 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.07 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  27.87 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  27.87 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.19 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  23.85 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  31.34 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.19 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  22.33 
 
 		 268 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  23.3 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  33.96 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  26.44 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.13 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  30.34 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  29.67 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>