139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0827 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  86.92 
 
 
131 aa  239  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08920  Carboxymuconolactone decarboxylase  65.71 
 
 
118 aa  153  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1032  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.36 
 
 
117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  62.62 
 
 
121 aa  144  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  57.52 
 
 
127 aa  143  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  54.39 
 
 
116 aa  142  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  55.45 
 
 
116 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  57.14 
 
 
121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.18 
 
 
127 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  56.19 
 
 
121 aa  130  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0411  alkylhydroperoxidase AhpD  49.56 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331538  normal  0.0612182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  34.26 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.26 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.08 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.26 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  31.19 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  32.2 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.91 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  34.29 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.73 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  30.91 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.97 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 
114 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 
114 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  29.52 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.19 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.88 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.25 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  29.25 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  29.25 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  34.88 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.19 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  29.25 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  29.25 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.61 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.1 
 
 
211 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1150  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.36 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  32.38 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.23 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  36.23 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  36.23 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  37.93 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.81 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  32.98 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  32.98 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.52 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.51 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  26.13 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  30.91 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  30.63 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  33 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  31.33 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  31.73 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  28.07 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.63 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5610  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.070686  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  36.9 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  28.71 
 
 
111 aa  53.5  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
122 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  28.71 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  30.59 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  28.57 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.58 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.58 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.44 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.48 
 
 
118 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.44 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.44 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.44 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.93 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  30.26 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.14 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  35.21 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.11 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.25 
 
 
203 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1981  alkylhydroperoxidase  31.48 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.893861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.85 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  25.69 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  32.88 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1720  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0242433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  30.56 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  28.7 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  36.25 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  30.56 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>