39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1720 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1720  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 104 aa  203  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0242433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0576  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.39 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.42772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1570  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0999  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.31 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0663684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3514  hypothetical protein  33.67 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0779069  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2050  carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  36.63 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.83 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.89 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.64 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  32.32 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  41.56 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  41.56 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  32.65 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  36.56 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  36.36 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  32.65 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  40.26 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.26 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  40.26 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  30.56 
 
 		 113 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  30.56 
 
 		 113 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 		 144 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.21 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  35.44 
 
 		 138 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 144 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 		 116 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>