14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0999 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0999  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0663684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3514  hypothetical protein  43.43 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0779069  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1570  carboxymuconolactone decarboxylase  42 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2050  carboxymuconolactone decarboxylase  38 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1720  carboxymuconolactone decarboxylase  34.31 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0242433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0576  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.37 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.42772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  29.59 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  30.12 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  30.12 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  29.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  30.61 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  30.11 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>