18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0576 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0576  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 102 aa  202  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.42772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1720  carboxymuconolactone decarboxylase  61.39 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0242433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1570  carboxymuconolactone decarboxylase  40.59 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2050  carboxymuconolactone decarboxylase  40.51 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  33 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0999  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.37 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0663684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3514  hypothetical protein  29.29 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0779069  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  37 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  36 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.18 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.89 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.03 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0657  carboxymuconolactone decarboxylase domain-containing protein  35.29 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 		 144 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>