43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1570 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1570  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
102 aa  207  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2050  carboxymuconolactone decarboxylase  63 
 
 
101 aa  133  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0999  Carboxymuconolactone decarboxylase  42 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0663684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3514  hypothetical protein  41.58 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0779069  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0576  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.59 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.42772  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1720  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0242433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0808  carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 
211 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  31.58 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.65 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0351  carboxymuconolactone decarboxylase domain-containing protein  34.78 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.68 
 
 
111 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  35.53 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  35.53 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  34.15 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  31.03 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 
115 aa  42.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  36.36 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1895  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.56 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00163146  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.68 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.67 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.68 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  37.88 
 
 
116 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  30.99 
 
 
120 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  30.68 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  34.67 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1693  carboxymuconolactone decarboxylase  26.44 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.72 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  31.82 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0717  carboxymuconolactone decarboxylase  31.51 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226817  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.71 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2960  carboxymuconolactone decarboxylase  26.44 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00839552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  33.78 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.85 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.1 
 
 
115 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  35.53 
 
 
131 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>