122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0411 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0411  alkylhydroperoxidase AhpD  100 
 
 
132 aa  273  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331538  normal  0.0612182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  48.18 
 
 
116 aa  116  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  52.83 
 
 
121 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  52.83 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.56 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.41 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  46.61 
 
 
131 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  44.12 
 
 
116 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  49.06 
 
 
127 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1032  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.47 
 
 
117 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08920  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.46 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  32.14 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.11 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  33.98 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  36.9 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.09 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.78 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.36 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.29 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  38.36 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 
132 aa  53.9  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  28.57 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  34.12 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  36.92 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.82 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  32.95 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  40.62 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.82 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.59 
 
 
115 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.07 
 
 
203 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.82 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.82 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.07 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.82 
 
 
116 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.82 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  28.57 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.82 
 
 
211 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  32.14 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  31.65 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  32.91 
 
 
126 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1150  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.33 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.39 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.14 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  46 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.82 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5993  alkylhydroperoxidase AhpD  33.9 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.451966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.82 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  29.27 
 
 
268 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  38.1 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.38 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  38.71 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.82 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  25.45 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.23 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  38.71 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5610  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.070686  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.67 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  32.47 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  29.27 
 
 
120 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  34.25 
 
 
101 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.18 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.29 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.38 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  29.67 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  38.71 
 
 
114 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.38 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.03 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.8 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0615  alkylhydroperoxidase  29.58 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  34.92 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.68 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  24.53 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  29.58 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  24.53 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  25 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.88 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  38.18 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>