142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3671 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  77.97 
 
 		 120 aa  190  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  72.57 
 
 		 116 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  72.57 
 
 		 115 aa  165  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  36.61 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.38 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.48 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.19 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  42.65 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  30.56 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.11 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  39.73 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  38.3 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  34.62 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0615  alkylhydroperoxidase  42.19 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0411  alkylhydroperoxidase AhpD  28.95 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331538  normal  0.0612182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.49 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.29 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.29 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.29 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  39.08 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  35.56 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  33.63 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.4 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.63 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.71 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  33.63 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  33.63 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  33.63 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  33.78 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.03 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.14 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.36 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  31.31 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  29.47 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  29.82 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.72 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  32.43 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.59 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.44 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.31 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.3 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.12 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  34.25 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  32.5 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  29.2 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  29.63 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  31.08 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.63 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  33.78 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  33.78 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  27.08 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0991  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  30.61 
 
 		 274 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.33 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.63 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.75 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.42 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  34.09 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  35.64 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  32.43 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  31 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  31.68 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  40.98 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  40.98 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.73 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  34.12 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  32.94 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5993  alkylhydroperoxidase AhpD  43.1 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.451966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.72 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  40.98 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  31 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.62 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  28.41 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0163  carboxymuconolactone decarboxylase  33.98 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  28.4 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.76 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  30.19 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  26.74 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  30.19 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  25.23 
 
 		 121 aa  43.9  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.29 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  39.66 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2858  carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  34.31 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  30.39 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  37.84 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>