198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4131 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 115 aa  235  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  82.35 
 
 		 117 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  65.09 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  68.75 
 
 		 114 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  62.26 
 
 		 111 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  58.12 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  65.66 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  51.14 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.15 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.71 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  40.4 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  40.43 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.3 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.32 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  44.32 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.32 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  44.32 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  44.32 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  44.32 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  43.53 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1090  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.04 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  39.78 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.45 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  40.21 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.86 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.86 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  39.56 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  39.56 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  42.11 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  44.19 
 
 		 114 aa  66.6  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  44.58 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  37.21 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.67 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  44.58 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.38 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  39.6 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  43.02 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  40.23 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  38.71 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.53 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  40.45 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.78 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.43 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.78 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  38.1 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  40.7 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.48 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.02 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.96 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  36.28 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  37.65 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.46 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.38 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  38.38 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  38.38 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  37.21 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2589  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  40.7 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2858  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.07 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2638  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2554  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.78 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  42.03 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2829  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.571755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2835  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  37.78 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  42.17 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  35 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  45.31 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  47.76 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.88 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  47.76 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  34.88 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.82 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  37.11 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.96 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  37.11 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  31.53 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.67 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.96 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  42.65 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  41.86 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  34.09 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  35.64 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  39.71 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.86 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>