140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1223 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 113 aa  229  7.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.653003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  43.43 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.23 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  30.7 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  32.98 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  32.98 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  34.09 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  34.88 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  37.35 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.86 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.69 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.53 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.53 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.64 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  33.03 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  33.7 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.4 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2589  carboxymuconolactone decarboxylase  29.21 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  38.55 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  34.57 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  27.55 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2638  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2554  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  39.73 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.46 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2835  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2829  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.571755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.13 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.53 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  27.55 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  31.96 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.25 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.73 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  35 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2858  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  31.52 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  32.97 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  32.97 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  37.36 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.01 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  37.36 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.85 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  33.73 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.97 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  32.97 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  32.97 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  27.1 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  32.05 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  28.32 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  28.87 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  33.72 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0615  alkylhydroperoxidase  31.76 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.05 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  32.58 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  34.57 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  32.05 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.09 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  41.79 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1032  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.77 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  28.87 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.24 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.32 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  28.24 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.53 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.59 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.21 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.47 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  28.87 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  29.9 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  32.56 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  32.47 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  32.18 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  37.14 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  35.62 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.47 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.04 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  32.89 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>