22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1378 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1378  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 94 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3145  carboxymuconolactone decarboxylase  61.97 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.821034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4057  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  41.98 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2449  alkylhydroperoxidase  39.71 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00215332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0858  alkylhydroperoxidase  44.23 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0911009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1758  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.67 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.736149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0547  hypothetical protein  34.48 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  41.82 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  35.62 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1183  hypothetical protein  34.04 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  32.73 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  44.68 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2010  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.76 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.91 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 		 112 aa  40  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 		 114 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.17 
 
 		 110 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>