30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0858 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0858  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 88 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0911009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2449  alkylhydroperoxidase  52.31 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00215332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1378  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1758  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.18 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.736149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  40.35 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3145  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.821034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4057  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  50 
 
 		 384 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  38.89 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1183  hypothetical protein  32.84 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0807  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.81 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0547  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 115 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  38.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  31.88 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  35.19 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.48 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  36.67 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 112 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  32.47 
 
 		 145 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>