13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3145 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3145  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 166 aa  329  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.821034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1378  alkylhydroperoxidase  61.97 
 
 		 94 aa  88.2  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4057  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38.75 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0858  alkylhydroperoxidase  43.18 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0911009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2449  alkylhydroperoxidase  36.21 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00215332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1183  hypothetical protein  32.08 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  38.24 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0547  hypothetical protein  32.43 
 
 		 86 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  43.18 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  30 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 		 177 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>