54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1758 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1758  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.736149  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0547  hypothetical protein  44.44 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  45.28 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2449  alkylhydroperoxidase  43.14 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00215332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1378  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  47.83 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  47.83 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  43.86 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.08 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0858  alkylhydroperoxidase  42 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0911009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  38.18 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4057  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.78 
 
 
384 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.73 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.82 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.38 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.23 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.51 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.86 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.38 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  44.23 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  45.65 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
115 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  37.7 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 
112 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.68 
 
 
110 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 
117 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.11 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  40.38 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.18 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  36.54 
 
 
131 aa  41.2  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.38 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  44.23 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1183  hypothetical protein  37.74 
 
 
101 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  42.31 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  44.23 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.76 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.23 
 
 
109 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>