210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0068 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0068  DNA-binding response regulator  100 
 
 
424 aa  848    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  76.99 
 
 
115 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.87 
 
 
115 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  64.49 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  64.49 
 
 
211 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  64.49 
 
 
116 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  59.48 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  65.66 
 
 
104 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  65.66 
 
 
104 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  65.66 
 
 
104 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  65.66 
 
 
104 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  50.48 
 
 
118 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.9 
 
 
123 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  46.9 
 
 
123 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  49.53 
 
 
125 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  47 
 
 
113 aa  97.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  47 
 
 
113 aa  97.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  47.27 
 
 
115 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.95 
 
 
125 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.66 
 
 
118 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.71 
 
 
123 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.64 
 
 
115 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  43.81 
 
 
126 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.76 
 
 
126 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  45.19 
 
 
115 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  44.55 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.58 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.82 
 
 
120 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.53 
 
 
109 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  46.24 
 
 
116 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 
109 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 
108 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.78 
 
 
117 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.61 
 
 
109 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 
109 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 
109 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 
109 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  45.05 
 
 
112 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  39.8 
 
 
121 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  91.43 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  40.86 
 
 
114 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  86.11 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  40.86 
 
 
117 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  40.86 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  37.38 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.39 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  37.39 
 
 
120 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  37.25 
 
 
113 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.04 
 
 
122 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.3 
 
 
113 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  38.3 
 
 
113 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  38.3 
 
 
113 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  34.62 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
113 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
113 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  33.04 
 
 
153 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  33.04 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
112 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.37 
 
 
113 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  36.61 
 
 
112 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.13 
 
 
117 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.86 
 
 
224 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.42 
 
 
110 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  34.91 
 
 
119 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  34.78 
 
 
119 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  36.21 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.23 
 
 
111 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.23 
 
 
111 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  36.73 
 
 
138 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 
115 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  77.14 
 
 
222 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  35.09 
 
 
116 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
149 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  37.25 
 
 
115 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  84.85 
 
 
223 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  81.82 
 
 
221 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  81.82 
 
 
227 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  34.02 
 
 
111 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
115 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.65 
 
 
111 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.02 
 
 
123 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34 
 
 
119 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  32.99 
 
 
111 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.74 
 
 
117 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.61 
 
 
113 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  71.43 
 
 
218 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  51.92 
 
 
242 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  34.34 
 
 
113 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  33.03 
 
 
109 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.36 
 
 
122 aa  56.6  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  68.57 
 
 
220 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.68 
 
 
114 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 
137 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  63.89 
 
 
220 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  63.89 
 
 
220 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 
235 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  72.73 
 
 
223 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.44 
 
 
151 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  32 
 
 
112 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  72.73 
 
 
232 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>