22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0545 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0545  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 369 aa  727    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6991  hypothetical protein  51.83 
 
 		 374 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220253  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2703  alkylhydroperoxidase  50.95 
 
 		 360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582162  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.11 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4103  hypothetical protein  45.81 
 
 		 342 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0845  alkylhydroperoxidase  37.09 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1760  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.31 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0293  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.02 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0548  carboxymuconolactone decarboxylase  42.73 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12189  hypothetical protein  39.64 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.25676e-41  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5896  hypothetical protein  28.74 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.48 
 
 		 176 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.42 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.61 
 
 		 201 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.12 
 
 		 211 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 134 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 144 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.16 
 
 		 188 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.32 
 
 		 176 aa  43.1  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 177 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.47 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38 
 
 		 135 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.36901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>