181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1241 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  93.65 
 
 
207 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  77.72 
 
 
509 aa  323  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  73.96 
 
 
192 aa  303  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  79.14 
 
 
204 aa  292  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.2 
 
 
189 aa  151  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  38.98 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 
203 aa  117  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  34.97 
 
 
201 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.78 
 
 
197 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.16 
 
 
184 aa  104  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0284  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  32.28 
 
 
189 aa  89  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  29.27 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  29.27 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.49 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.86 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.86 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  30.86 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.86 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  30.86 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.86 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  30.86 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.49 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.61 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.65 
 
 
152 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1217  hypothetical protein  20.79 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.23 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.79 
 
 
159 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  28.79 
 
 
159 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
154 aa  58.2  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  33.33 
 
 
158 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.53 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.95 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.34 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  28.03 
 
 
159 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.62 
 
 
145 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  23.03 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  28.91 
 
 
159 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  28.91 
 
 
159 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  30.84 
 
 
159 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.99 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.79 
 
 
159 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.16 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.39 
 
 
153 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  32.99 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  28.1 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.97 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  27.03 
 
 
156 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  28.35 
 
 
151 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.09 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  30.08 
 
 
151 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  30.61 
 
 
167 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  30.84 
 
 
145 aa  51.2  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.65 
 
 
157 aa  51.2  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.95 
 
 
143 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.27 
 
 
145 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.52 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.95 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.53 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.48 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.73 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  27.07 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  23.56 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.29 
 
 
145 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  31.29 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  27.19 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 
157 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.71 
 
 
149 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  26.49 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  35.06 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.36 
 
 
163 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.52 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.06 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  27.93 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  28.67 
 
 
157 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.36 
 
 
163 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 
151 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  24.82 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 
155 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 
158 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.46 
 
 
145 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.27 
 
 
150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.64 
 
 
150 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  28.43 
 
 
144 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>