260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0988 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  74.12 
 
 		 170 aa  253  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  69.41 
 
 		 174 aa  244  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  48.77 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  47.34 
 
 		 179 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.21 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  41.96 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  40.59 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  42 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  40.13 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  39.49 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  38.93 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  34.1 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  35.5 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.4 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  34.03 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  28.25 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  34.72 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  34.03 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  34.03 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  34.03 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  30.32 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.32 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  30.32 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  30.99 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  30.88 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  32.03 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  27.48 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  32.24 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  25.84 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.82 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.2 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  31.67 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  30.3 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.49 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  31.36 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25.99 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.17 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  28.24 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  28.29 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  33.9 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  33.9 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  27.56 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.46 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  31.76 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  26.71 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  25.31 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  24.69 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.86 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  26.36 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  24.48 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  26.75 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.16 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  26.75 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.56 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  26.53 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  26.53 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  24.65 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  26.53 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  27.08 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  31.88 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  26.75 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  23.78 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  26.75 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  23.78 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.53 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  26.53 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  26.53 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.77 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  27.93 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  27.93 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  27.93 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  27.93 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  27.93 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  25.37 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>