241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1122 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
198 aa  401  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  37.95 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  37.95 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  39.18 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.84 
 
 
182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.84 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.84 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.84 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.26 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  29.87 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.85 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.82 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  28.85 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.93 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.68 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  25.86 
 
 
509 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.46 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  30.33 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.85 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  31.21 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
145 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.28 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.45 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  33.06 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.46 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  29.69 
 
 
145 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
145 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
145 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  24.14 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  34.38 
 
 
143 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  34.45 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 
145 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  32.38 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.45 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  28.99 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  34.45 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  29.13 
 
 
150 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.29 
 
 
145 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  34.45 
 
 
145 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.65 
 
 
155 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.26 
 
 
155 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  33.61 
 
 
145 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  34.45 
 
 
145 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.91 
 
 
152 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.75 
 
 
145 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  36.75 
 
 
149 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.1 
 
 
145 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.26 
 
 
152 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  31.97 
 
 
151 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  25.29 
 
 
204 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  32.79 
 
 
151 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  32.79 
 
 
151 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.61 
 
 
145 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.58 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.61 
 
 
152 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
173 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  23.56 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  23.56 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.78 
 
 
147 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  28.77 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.65 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  28.77 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  26.57 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.9 
 
 
145 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.07 
 
 
145 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.13 
 
 
150 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  31.15 
 
 
151 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  34.91 
 
 
152 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.05 
 
 
163 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  32.41 
 
 
162 aa  58.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  30.71 
 
 
159 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  36.27 
 
 
157 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  29.51 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  29.91 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.89 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  30.51 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.83 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.67 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  29.91 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.25 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  28.44 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0737  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 
144 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213985  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  31.73 
 
 
143 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  32.32 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  28.17 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.5 
 
 
159 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.2 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  27.66 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.79 
 
 
159 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.27 
 
 
185 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
129 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  30.66 
 
 
152 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  24.79 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>